土壤研究所主要承担土壤生态环境监管相关政策、规划、方案研究拟订工作，承担土壤生态环境相关技术调查、评估、咨询与服务等工作，承担污染地块、农业面源等相关领域生态环境监督管理技术支持工作，承担相关领域专家库建设管理、土壤环境管理信息平台应用研究等工作。
研究方向：
（一）污染地块环境风险全生命周期管控
以防范土壤环境风险为核心，严守人居环境安全底线，开展济南市污染地块环境风险全生命周期管控五大程序、七大技术环节相关技术研究。主要工作内容：污染地块土壤和地下水全生命周期管控标准体系研究；污染场地初步调查、详细调查、风险评估、风险管控、治理修复、工程施工、效果评估七大技术环节把控；污染地块土壤和地下水风险预警研究。
（二）农业面源污染防治
以保障土壤环境安全为核心，严守农产品质量安全底线，开展济南市农用地、农业面源相关污染防治技术研究。主要工作内容：以济南市黄河流域、新旧动能转换起步区为重点研究区域，开展土壤重金属及新型有机物研究；开展农田生态系统（如农田、设施数次、林地、绿地等）生态观测，进行农田生态系统碳排放监测和碳平衡研究。
主要项目：
（1）基础科研类
滨岸带土壤有机碳矿化对反硝化潜力的影响机制（山东省自然科学基金ZR2019PD007）
小清河污灌区农田土壤重金属形态分析及风险评价研究
小清河干流不同类型滨岸带对农业源氮素削减作用的研究
小清河流域农田土壤持久性污染物风险评价研究
济南地区典型土壤中重金属形态和有效性测定方法与标准化研究
欧盟抗生素和环境激素污染防治及受纳水体治理经验研究
基于畜禽粪肥使用的土壤中典型抗生素的归趋研究
济南市骨干河道及重要胡泊流域水系抗生素和环境激素分布和溯源分析研究
（2）环境管理类
济南市土壤污染防治工作方案（济政发〔2017〕15号）
济南市土壤污染治理与修复规划（济环字〔2018〕205号）
济南市土壤污染风险管控及修复技术应用研究
济南市重点行业企业用地土壤详查第一阶段
济南市重点行业企业用地土壤详查第二阶段
山东省重点行业企业用地调查基础信息采集与风险筛查纠偏省级技术支持
济南市土壤污染状况调查报告、风险评估报告、风险管控效果评估报告和修复效果评估报告专家审核项目
济南市“十四五”土壤生态环境保护规划（2021-2025年）
济南市土壤重点监管单位土壤污染防治责任落实核查与技术评估
原济南金源镀业厂区土壤污染状况调查
济南金源镀业有限公司锌污染场地修复方案
武城县污水处理厂扩建工程拟用地块场地风险评估
济钢老厂区调查-韩仓河底泥调查
郯城县地下水污染风险管控项目
山东钢铁股份有限公司莱芜分公司土壤污染调查与风险评估管控
山东莱芜润达新材料有限公司土壤污染隐患排查
诸城市“1.31”案件污染土壤应急处置项目环境监理